WWW.DISS.SELUK.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА
(Авторефераты, диссертации, методички, учебные программы, монографии)

 

На правах рукописи

Цаплина Людмила Александровна

КИНЕТИЧЕСКИЕ ЗАКОНОМЕРНОСТИ ЦИКЛООКСИГЕНАЗНОЙ И

ПЕРОКСИДАЗНОЙ РЕАКЦИЙ, КАТАЛИЗИРУЕМЫХ

ПРОСТАГЛАНДИН-Н-СИНТАЗОЙ

Специальность 03.00.02. - "Биофизика"

АВТОРЕФЕРАТ

диссертации на соискание учёной степени кандидата химических наук

Москва – 2007

Работа выполнена на биологическом факультете и факультете биоинженерии и биоинформатики Московского государственного университета им. М.В.

Ломоносова.

Научный руководитель: доктор химических наук, профессор Вржещ Петр Владимирович

Официальные оппоненты: доктор биологических наук, профессор Алесенко Алиса Владимировна доктор физ.-мат. наук, профессор Шайтан Константин Вольдемарович

Ведущая организация: Институт биохимии им. А.Н. Баха РАН, г. Москва

Защита состоится " " 2007 г. в часов на заседании Диссертационного совета Д 501.001.96 при Московском государственном университете им. М. В. Ломоносова по адресу: 119992, г. Москва, Ленинские горы, МГУ, биологический факультет, кафедра биофизики, аудитория "Новая".

С диссертацией можно ознакомиться в библиотеке биологического факультета МГУ им. М.В.Ломоносова.

Автореферат разослан: " " 2007 г.

Учёный секретарь Диссертационного совета доктор биологических наук, профессор Т. Е. Кренделева

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальность темы. Фермент простагландин-H-синтаза (PGHS, К.Ф.1.14.99.1) катализирует одну из ключевых реакций каскада арахидоновой кислоты превращение арахидоновой кислоты в простагландин H2, исходное соединение в биосинтезе всех простагландинов, тромбоксана и простациклина в организме большинства млекопитающих, в том числе человека. PGHS имеет два активных центра, на которых протекает циклооксигеназная (окисление арахидоновой кислоты до простагландина G2) и пероксидазная (восстановление перекисной группы простагландина G2 до спиртовой с образованием простагландина Н2) реакции.

Фермент PGHS – димер, состоящий из одинаковых субъединиц с молекулярным весом 72 кДа. Для проявления обеих активностей ферменту необходим гемин в качестве простетической группы. Существует две изоформы PGHS: конституционная, PGHS-1 и индуцибельная, PGHS-2. В настоящей работе исследовались свойства PGHS-1 из везикулярных желез (семенных пузырьков) барана.

Между двумя активностями PGHS существуют довольно сложные взаимоотношения: циклооксигеназная реакция не протекает в отсутствие перекисей, пероксидазная реакция идет как в присутствии, так и в отсутствие арахидоновой кислоты, а также в присутствии ингибиторов циклооксигеназы. Обе реакции PGHS сопровождаются быстрой и необратимой инактивацией фермента в процессе реакции.

До настоящего времени не существовало адекватной модели, описывающей кинетику PGHS. Бифункциональный характер PGHS является причиной того, все предложенные механизмы принципиально не подходят для описания работы этого фермента, так как предполагают использование уравнения материального баланса по сумме промежуточных форм фермента, участвующих в циклооксигеназной и пероксидазной реакциях. Такие механизмы характеризуются конкуренцией между реакциями, что противоречит экспериментальным данным. Адекватных моделей, описывающих инактивацию фермента, тоже нет. Систематически инактивация двух активностей PGHS не исследовалась, поэтому остается непонятной взаимосвязь инактивационных процессов в ходе обеих реакций. Этот круг вопросов и предстояло исследовать в данной диссертационной работе.

экспериментального исследования кинетических закономерностей катализа и инактивации фермента PGHS. Разработать кинетическую модель действия фермента PGHS, учитывающую его бифункциональный характер, предполагающую независимое, но взаимовлияющее, протекание реакций на одной молекуле фермента.

Разработать кинетические модели инактивации фермента PGHS.

Задачи исследования:

взаимовлияния реакций PGHS, инактивации в процессе реакции и инактивации при прединкубации с перекисями циклооксигеназной и пероксидазной активностей PGHS, а также для получения очищенных 2) Исследовать кинетические закономерности взаимодействия и взаимовлияния пероксидазной и циклооксигеназной реакций PGHS.

3) Исследовать кинетику инактивации циклооксигеназной активности в ходе протекания циклооксигеназной и пероксидазной реакций, и кинетику инактивации пероксидазной активности в ходе протекания циклооксигеназной и пероксидазной реакций.

пероксидазной активностей PGHS при прединкубации с перекисными субстратами пероксидазной реакции.

бифункционального фермента PGHS, учитывающие все особенности его действия и состояние его двух активных центров, основываясь на моделях многосубстратной ферментативной реакции, ферментативной реакции, подвергающейся необратимой инактивации и двумерной модели бифункционального фермента.

Научная новизна. На основе обобщенной двумерной модели действия бифункционального фермента, а также модели многосубстратной ферментативной реакции предложена кинетическая схема действия бифункционального фермента PGHS, которая в отличие от представленных в литературе схем, предусматривает независимое протекание двух ферментативных реакций на одной молекуле фермента и взаимное влияние этих реакций.



Предложен подход, заключающийся в исследовании кинетики инактивации обеих активностей PGHS в ходе протекания как циклооксигеназной, так и пероксидазной реакций.

Показано, что при прединкубации фермента с перекисью водорода инактивация каждой активности протекает как минимум в две стадии. При прединкубации PGHS с исследуемыми перекисями концентрация последних в широком диапазоне не влияет циклооксигеназной активности наблюдается зависимость константы скорости инактивации от концентрации перекиси, с которой проводили прединкубацию.

Исследование инактивации циклооксигеназной и пероксидазной активностей PGHS в различных условиях свидетельствует о том, что инактивация этих активностей имеет разные химические механизмы.

На основе обобщенной модели ферментативной реакции, подвергающейся необратимой инактивации, предложены модели, которые с помощью минимального количества параметров описывают наши и известные из литературы данные по инактивации PGHS.

Практическая значимость. Проведенные исследования позволили подробнее функционирования этого фермента.

Представленные в работе кинетические модели (двумерная модель действия бифункционального фермента, кинетическая модель инактивации в ходе реакции) бифункциональных ферментов.

Знание механизмов протекания реакций PGHS, важного фармакологического объекта, дает возможность скорректировать разработку новых лекарственных препаратов и способов контроля каскада арахидоновой кислоты in vivo.

Полученные в работе результаты, заключения и выводы могут быть использованы для подготовки по специализациям биофизика, катализ, биохимия и биотехнология.

Апробация работы. Результаты работы были доложены на Международной конференции "Ломоносов-2004" (Москва, 2004 г.), Международной молодежной конференции ИБХФ РАН-ВУЗы «Биохимическая физика» (Москва, 2005 г.), Международной молодежной конференции ИБХФ РАН-ВУЗы «Биохимическая физика» (Москва, 2006 г.), Международной конференции «Математическая биология и биоинформатика» (Пущино, 2006 г). Работа также докладывалась на семинарах кафедр биофизики, биоинженерии и биохимии биологического факультета МГУ.

Публикации. По материалам диссертации опубликовано 9 печатных работ, из них 4 в научных российских журналах (по списку ВАК), 5 в тезисах конференций.

Структура и объем диссертации. Диссертационная работа состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, результатов и их обсуждения, заключения, выводов, списка цитируемой литературы. Количество Сокращения, принятые в работе. PGHS – простагландин-Н-синтаза, Tyr* тирозил-радикал, PGG2 - простагландин G2, PGН2 - простагландин Н2, АА – арахидоновая кислота, D – донор электронов, PPIX – протопорфирин IX.

ОСНОВНОЕ СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ

Обзор литературы. В главе говорится о биологической роли и месте PGHS в Схема 1. Схема реакций, осуществляемых ферментом простагландин-Н-синтазой (PGHS). влияние различных ингибиторов на циклооксигеназную активность фермента. Рассмотрены имеющиеся в литературе сведения по инактивации PGHS в процессе катализируемых им реакций и проанализированы кинетические схемы, предложенные другими авторами. Рассмотрены кинетические особенности бифункциональных ферментов, представлен критический анализ предложенных механизмов для описания бифункциональных ферментов, многосубстратных реакций и инактивации ферментов.

Методы исследования. 1) Солюбилизированный препарат PGHS выделяли из везикулярных желез барана по методу [Van der Ouderaa et.al., 1977] с изменениями: во избежание существенных потерь фермента не добавляли твин-20 в буферный раствор для отмывки микросом.

2) Очистку солюбилизированного препарата PGHS проводили методом колоночной хроматографии на носителе DEAE Sepharose. Электрофоретическая чистота полученного препарата PGHS более 95%.

3) Концентрацию белка в препаратах фермента определяли с помощью колориметрических методов [Lowry et.al., 1951, Bradford, 1976].

4) Электрофорез в полиакриаламидном геле проводили в денатурирующих условиях с добавлением детергента додецилсульфата натрия по методу Лэмли [Laemmli, 1970].

циклооксигеназной реакции PGHS осуществляли амперометрически с использованием полярографа «АКПМ-02-05» (ООО «Фирма «Альфа БАССЕНС», Россия), снабженным газодиффузионным платино-серебряным электродом Кларка.

6) Измерение концентрации окисленной формы донора электронов для слежения за пероксидазной реакцией PGHS осуществляли с помощью спектрофотометра «Cary 100» («Varian Inc», США).

7) Методика обработки экспериментальных данных. Для получения значений констант экспериментальные данные аппроксимировали согласно полученным формулам методом нелинейной регрессии с использованием программы Origin 6. фирмы Microcal.

Результаты и обсуждение.

многосубстратные реакции, каждая из которых протекает на своем активном центре (схема 1, рис.1). Обе активности подвергаются необратимой инактивации, причем в циклооксигеназная, так и пероксидазная активности, а в процессе пероксидазной реакции может инактивироваться как пероксидазная, так и циклооксигеназная активности. Поэтому кинетическую схему действия PGHS целесообразно рассмотреть в общем виде, так как комбинаторный перебор всех возможных вариантов дает большое количество схем. Эта работа проведена с использованием разработанных ранее подходов [Вржещ, 1996]. Для создания кинетических моделей катализа и инактивации бифункционального фермента PGHS необходимо проанализировать модели многосубстратной ферментативной реакции, бифункционального фермента, и ферментативной реакции, подвергающейся необратимой инактивации.

На схеме 2 представлен механизм неразветвленной ферментативной реакции.

Схема 2. Обобщенная модель неразветвленной ферментативной реакции, сопровождающейся необратимой инактивацией фермента в процессе реакции.

Ei (1 i n) - каталитически активные промежуточные формы фермента (интермедиаты), i и i (1 i n ) - константы скорости реакций первого (псевдопервого) порядка для реакций взаимопревращения интермедиатов.

Взаимодействие субстрата с промежуточной формой фермента Ei выражается в том, что константа скорости i является константой скорости псевдопервого порядка и равна константе скорости второго порядка прямой реакции, умноженной на концентрацию этого субстрата. Взаимодействие продукта с промежуточной формой фермента Ei+1 и отщепление продукта от промежуточной формы фермента Ei выражается в том, что константа скорости i является константой псевдопервого порядка, и равна константе скорости второго порядка обратной реакции, умноженной на концентрацию этого продукта.

подвергаться необратимой инактивации ( E * - инактивированные формы фермента).

Процессы необратимой инактивации интермедиатов Ei характеризуются константами скорости первого (псевдопервого) порядка i 0 (1 i n). В данной работе проанализированы уравнения, описывающие подобные схемы (схема 2) и определены качественные критерии кинетического поведения таких схем, необходимых для построения кинетической схемы PGHS.

Бифункциональный фермент катализирует протекание двух необратимых реакций (A и B). Кинетика реакций описывается в рамках механизма упорядоченной (неразветвленной) многосубстратной ферментативной реакции ((1) и (2)).

Реакция A:

Реакция B:

Наличие у фермента двух активных центров приводит к необходимости в кинетических схемах одновременно учитывать состояние первого и второго активного центра, интермедиаты в кинетических схемах должны характеризоваться двумя индексами. Учет независимого изменения величин двух индексов превращает кинетические схемы в «двумерные».

При одновременном присутствии компонентов реакций A и B и независимом одновременном протекании реакций A и B суммарный механизм процесса будет иметь двумерный характер и может быть представлен в виде матрицы, фрагмент которой на примере промежуточной формы Ekl показан на схеме 3.

Схема 3. Фрагмент обобщенной двумерной модели действия бифункционального фермента.

Предусматривается, что в результате завершения цикла в вертикальном направлении происходит один оборот реакции A, в результате завершения цикла в горизонтальном направлении происходит один оборот реакции B. Зависимости стационарных скоростей v A и v B от концентраций субстратов S A и S B имеют вид дробно-рациональных функций (3), (4):

Аналогичным образом выглядят уравнения для v B.

Только в том случае, если протекание одной реакции не меняет величину кинетических констант другой реакции, и наоборот, реакции A и B протекают строго независимо и могут быть описаны отдельно как две независимые ферментативные реакции (1) и (2).

гиперболичности скорости одной ферментативной реакции в случае присутствия в реакционной среде компонентов другой реакции, а также к появлению зависимости скорости одной ферментативной реакции от концентрации субстрата другой реакции.

Необходимо также рассмотреть инактивацию бифункционального фермента.

Каждый промежуточный интермедиат (схема 3) может обладать или двумя различными активностями, или одной, или не обладать активностью. В общем виде рассматривать инактивацию обеих активностей фермента нецелесообразно. Элементы общей схемы инактивации для частного случая рассмотрены при обсуждении конкретных экспериментов (схема 7).

Исследование взаимовлияния реакций. Исследовали влияние субстратов циклооксигеназной реакции PGHS и обратимого ингибитора циклооксигеназы напроксена на начальную скорость пероксидазной реакции, а также субстратов пероксидазной реакции на начальную скорость циклооксигеназной реакции.

Влияние доноров электронов, субстратов пероксидазной реакции, на циклооксигеназной реакции от концентрации доноров электронов TMPD, ABTS, Lадреналина, ферроцианида калия (рис.2, 3).

V0, мкМ O2/с Рис.2: Зависимость начальной скорости Рис.3: Зависимость начальной скорости циклооксигеназной реакции от концентрации циклооксигеназной реакции от концентрации донора электронов. Концентрация TMPD при концентрациях арахидоновой арахидоновой кислоты – 100 мкМ, гемина – 2 кислоты 40, 75, 100, 180 мкМ (1 - мкМ. Кривые построены при аппроксимации соответственно). Кривые построены при экспериментальных данных согласно аппроксимации экспериментальных данных уравнению (6). 1 – ABTS, K6 = 0, V1/V2 = 2,2, согласно уравнению (6). V1ср.=0,66; V2ср.=0,22, K1/K2 = 28, V2 = 0,58; 2 – L-адреналин, K6 = 0, K1ср. = 12; K2ср. = 0,81; K3ср. = 1,3; K4ср. = 0,44.

V1/V2 = 1,6, K1/K2 = 3, V2 = 0,52; 3 – ферроцианид калия, K6 = 0, V1/V2 = 1,8, K1/K2 = 15, V2 = 0,5.

В отсутствие донора электронов циклооксигеназная реакция протекает, однако, в присутствии донора электронов скорость циклооксигеназной реакции увеличивается.

Для доноров электронов ABTS, L-адреналина и ферроцианида калия наблюдается зависимость «с насыщением» без ингибирования (Рис.2).

, (мкМ О2/с) COX 1/v Увеличение концентрации донора электронов TMPD до определенного значения повышает скорость циклооксигеназной реакции, а при дальнейшем увеличении концентрации TMPD – понижает (Рис.3). Характер рисунков 3 и 4 говорит о конкурентных отношениях донора электронов TMPD и арахидоновой кислоты за центр связывания субстрата циклооксигеназной реакции, по крайней мере, неконкурентные отношения в чистом виде отсутствуют (рис.4). Так как зависимость взаимодействия фермента с арахидоновой кислотой в первом приближении можно описать в рамках модели Михаэлиса-Ментен.

циклооксигеназную реакцию PGHS.

В отдельных экспериментах было показано, что добавление перекиси водорода к смеси для проведения циклооксигеназной реакции PGHS (как в отсутствие, так и в присутствии донора электронов) уменьшает начальную скорость циклооксигеназной циклооксигеназной активности на 20-25%.

Влияние напроксена, ингибитора циклооксигеназной реакции PGHS, на циклооксигеназную и пероксидазную реакции. Напроксен относится к нестероидным противовоспалительным препаратам и является хорошо известным быстрым Добавление напроксена вызывает быстрое и практически полное подавление циклооксигеназной активности PGHS (рис.5).

Присутствие напроксена во время протекания пероксидазной реакции (рис.6) практически не влияет на начальную скорость, а лишь незначительно уменьшает константу скорости инактивации PGHS в ходе пероксидазной реакции при добавлении напроксена до начала пероксидазной реакции по сравнению с контролем.

Влияние арахидоновой кислоты, субстрата циклооксигеназной реакции PGHS, на пероксидазную реакцию. В присутствии арахидоновой кислоты, пероксидазной реакции практически не меняется. Добавление напроксена в эту систему также не отражается на начальной скорости пероксидазной реакции.

Таким образом, можно сделать вывод о том, что активный центр пероксидазной циклооксигеназной реакции. Реализуется случай, когда протекание одной реакции не влияет на протекание другой.

[O2], мкМ Рис.5: Влияние напроксена на кинетику Рис.6: Влияние напроксена на кинетику циклооксигеназной реакции. 1 – контроль (ABTS – пероксидазной реакции. 1 – контроль (ABTS мкМ, AA – 150 мкМ, гемин – 2 мкМ, PGHS – 15 750 мкМ, H2O2 - 1,5 мМ, PGHS - 5,4 мкг/мл); мкг/мл); 2 - контроль +напроксен (1 мМ, добавлен - контроль + напроксен (1 мМ, добавлен до до внесения фермента); 3 - контроль + напроксен (1 внесения фермента); 3 - контроль + напроксен мМ, добавлен на пятой секунде реакции); 4 - (1 мМ, добавлен на 5 секунде реакции); 3 контроль + напроксен (1 мМ, добавлен на десятой контроль + напроксен (1 мМ, добавлен на [ABTS], мкМ пероксидазной реакции PGHS не зависит от протекания циклооксигеназной реакции.

Напротив, из литературы известно, что для протекания циклооксигеназной реакции необходимы следовые количества перекиси [Hemler et. al., 1978] (в отсутствие перекисей наблюдается лаг-период). В этом случае протекает пероксидазная реакция, и происходит образование тирозил-радикала, играющего роль исходного окислителя в свободнорадикальном механизме циклооксигеназной реакции (схема.4). Скорость циклооксигеназной Схема 4. Этапы превращения арахидоновой кислоты в PGG2 признаков конкурентных во время протекания циклооксигеназной реакции [Kulmacz et. взаимоотношений между ними.

al., 2003].

разработок обобщенной двумерной модели действия бифункционального фермента (схема 3) нами предложена кинетическая схема действия PGHS, предусматривающая независимое протекание двух ферментативных реакций на одной молекуле фермента, допускающая взаимовлияние этих реакций (схема 5).

III III

[ (PPIX) FeIII ]

ROH ROH

ROOH ROOH

Схема 5. Схема действия PGHS.

Образование тирозил-радикала не показано, так как этот процесс происходит относительно быстро (спустя 1–2 секунды после начала реакции) [Marshall et. al., 1987], а мы рассматриваем работу фермента в стационарном приближении и рассмотрения подтверждается отсутствием лаг-периода в наших экспериментах.

Завершение цикла в вертикальном направлении (схема 5) соответствует одному акту катализа пероксидазной реакции, завершение цикла в горизонтальном направлении – одному акту катализа циклооксигеназной реакции. Принципиальное отличие этой схемы от всех предлагавшихся ранее состоит в том, что материальный баланс ведется отдельно по всем возможным промежуточным состояниям фермента, и реакции могут протекать по разным маршрутам.

Для схемы (схема 5) зависимость начальной скорости циклооксигеназной реакции от концентрации донора электронов в стационарном режиме выражается следующим образом:

где [D] – концентрация донора электронов, константы ei и di выражаются через константы скоростей элементарных стадий и концентрации других участников реакции, причем ei 0 (0 i 4), di 0 (0 i 4). В уравнении (5) присутствует шестая степень, за счет того, что донор электронов дважды принимает участие механизме реакции.

Такая зависимость, при определенных соотношениях между константами ei и di описывает стимулирование циклооксигеназной реакции с увеличением концентрации донора электронов. Уравнением (5) можно описать не только увеличение скорости циклооксигеназной реакции при малых концентрациях донора электронов, но и уменьшение при больших. Однако способность ингибировать циклооксигеназную реакцию зависит от природы донора электронов и не присуща всем донорам. Поэтому это явление необходимо описать отдельно.

Так как протекание пероксидазной реакции не зависит от циклооксигеназной, все кинетические константы у реакций, протекающих в вертикальном направлении, соответственно равны друг другу. В горизонтальном направлении лимитирующей стадией является стадия отщепления атома водорода от арахидоновой кислоты [Hamberg et. al., 1974], представленная на схеме 5 стадией присоединения арахидоновой кислоты.

Для описания ингибирования циклооксигеназной реакции донором электронов TMPD проведено экспериментально обоснованное упрощение схемы 5 и предложена схема 6.

Схема 6. Схема циклооксигеназной реакции.

следующую зависимость наблюдаемой стационарной скорости циклооксигеназной реакции от концентрации арахидоновой кислоты и TMPD:

где K1, K2, K3, K4 – функции констант скоростей реакций. Экспериментально показано, что скорость циклооксигеназной реакции увеличивается при добавлении донора электронов (рис.2, 3). При этом увеличивается доля восстановленного фермента, следовательно восстановленные формы фермента более каталитически активны по отношению к циклооксигеназной реакции.

Схема 5 и уравнение (6) описывают полученные нами экспериментальные данные (рис.2, 3, 4). Согласно уравнению (6) зависимость начальной скорости циклооксигеназной реакции от концентрации арахидоновой кислоты линейна в двойных обратных координатах, что согласуется с экспериментальными данными (рис. 4).

Инактивация циклооксигеназной и пероксидазной активностей PGHS в процессе катализа. Для исследования механизмов инактивации циклооксигеназной и пероксидазной активностей PGHS нами был разработан методологический подход, заключающийся в том, что мы сравнивали скорость инактивации циклооксигеназной активности PGHS, обусловленной протеканием самой циклооксигеназной реакции (т.е. инактивации в процессе реакции), со скоростью инактивации пероксидазной активности PGHS, обусловленной протеканием циклооксигеназной реакции. И наоборот: сравнивали скорость инактивации пероксидазной активности PGHS, обусловленной протеканием самой пероксидазной реакции (т.е. инактивации в процессе реакции) со скоростью инактивации циклооксигеназной активности PGHS, обусловленной протеканием пероксидазной реакции.

Влияние времени инкубации фермента PGHS в условиях протекания циклооксигеназной реакции на пероксидазную и циклооксигеназную активности.

Фермент инкубировали в присутствии субстратов циклооксигеназной реакции (арахидоновая кислота, растворенный кислород) в стандартном буферном растворе.

[TMPD], мкМ

AA PGHS

ВРЕМЯ ПРОТЕКАНИЯ

AA ЦИКЛООКСИГЕНАЗНОЙ РЕАКЦИИ

После заданного времени протекания циклооксигеназной реакции с целью определения пероксидазной активности PGHS в ту же реакционную смесь одновременно добавляли перекись водорода и донор электронов. За происходящими процессами следили с помощью полярографической и спектрофотометрической методик. Полярографически наблюдали изменение концентрации кислорода (рис.8, кривая 1), которое после добавления PGHS соответствует циклооксигеназной реакции. Спектрофотометрически следили за накоплением окисленной формы донора электронов (рис.8, кривая 2). Как видно из рис.8, после добавления донора электронов и перекиси водорода наблюдается изменение концентрации окисленной формы донора электронов вследствие пероксидазной реакции. Определяли начальную скорость пероксидазной реакции, а в качестве количественной характеристики пероксидазной активности использовали относительную активность (рис 9а, квадраты, кружки). Относительная циклооксигеназная активность представлена как функция времени протекания циклооксигеназной реакции (рис.9а, треугольники, ромбы).

Полученные экспериментальные зависимости описывали с помощью эмпирического уравнения (7), по которому определяли значения констант скорости инактивации () (аппроксимации не показаны).

Величина пероксидазной активности (рис.9а) составляет 5 мин-1, текущей скорости циклооксигеназной активности 4,55,5 мин-1 (рис.9а). Аппроксимация экспериментальных данных по эмпирическому уравнению (7) дает возможность сравнивать скорости представленных процессов друг с другом и делать предположения о кинетических механизмах. В отдельных экспериментах было показано (например, рис.9а, треугольники, ромбы), что значения не зависят от концентрации PGHS. На рисунках 9а, 9б и 10 представлены аппроксимации по уравнениям (9), (10). Эти уравнения получены в результате рассмотрения схемы 7 и описаны далее.

относительная активность (9), пунктирные (треугольники, ромбы) – согласно уравнению (10).

проводилась в отсутствие донора электронов. На рис.9б показана инактивация обеих активностей в ходе циклооксигеназной реакции в присутствии донора электронов.

Значение пероксидазной реакции PGHS, полученное по уравнению (7) равно 0, мин-1, а циклооксигеназной реакции - 2,9 мин-1 (рис. 9б).

Добавление донора электронов во время протекания циклооксигеназной реакции (рис.9б) приводит к уменьшению величины пероксидазной и циклооксигеназной активность от инактивации в существенно большей степени, чем циклооксигеназную.

пероксидазной активности (рис.9б). Можно сделать вывод о том, что инактивация циклооксигеназной реакции идет по различным механизмам.

пероксидазной реакции на циклооксигеназную и пероксидазную активности.

Фермент инкубировали в присутствии субстратов пероксидазной реакции (перекись водорода, донор электронов). После заданного времени протекания пероксидазной реакции (время варьировали) с целью определения циклооксигеназной активности в ту же реакционную смесь добавляли арахидоновую кислоту. За происходящими процессами следили с помощью спектрофотометрической и полярографической методик. Спектрофотометрически наблюдали изменение концентрации окисленной формы донора электронов, которое после добавления PGHS соответствует пероксидазной реакции. Полярографически наблюдали изменение концентрации кислорода и определяли начальную скорость циклооксигеназной реакции. На рис. представлена относительная циклооксигеназная активность, а также относительная пероксидазная активность как функция времени протекания пероксидазной реакции.

относительная активность время протекания пероксидазной реакции, с экспериментальных данных согласно уравнению качестве донора электронов TMPD величина циклоокигеназной активности PGHS, полученная по уравнению (7), равна 1,1-1,4 мин-1, а пероксидазной активности - 3мин-1. Для донора электронов ферроцианида калия величина циклоокигеназной реакции PGHS, полученная по уравнению (7), равна 0,5-1 мин-1, а пероксидазной реакции - 2-2,7 мин-1 (рис. 10).

Инактивация циклооксигеназной активности в процессе протекания пероксидазной реакции идет медленнее, чем инактивация пероксидазной, причем при использовании ферроцианида калия значения обеих активностей меньше, чем при использовании TMPD. При полной инактивации пероксидазы сохраняется 30-40% циклооксигеной активности (рис.10). Можно сделать вывод о том, что инактивация пероксидазной и циклооксигеназной активностей в условиях протекания пероксидазной реакции идет по различным механизмам.

Для проведения данного (рис.10) и ряда других экспериментов (рис.11) использовали очищенный препарат PGHS. Свойства солюбилизированного и очищенного препарата одинаковы, за исключением наличия у солюбилизированного препарата каталазной активности, препятствующей измерению циклооксигеназной активности PGHS в присутствии перекиси водорода.

Кинетическая модель инактивации циклооксигеназной и пероксидазной активностей PGHS в процессе протекания катализируемых им реакций. Так как в свободном состоянии PGHS не подвергается инактивации, и процессы инактивации происходят во время протекания реакций, следовательно, они идут через промежуточные соединения – интермедиаты. Как показывают рисунки 9а, 9б и 10, ход изменения относительных циклооксигеназной и пероксидазной активностей в ряде случаев существенно различается. Следовательно, потеря циклооксигеназной и пероксидазной активностей – различные процессы.

Если предположить, что в первом приближении процессы инактивации в ходе одной и той же инкубации протекают через одни и те же интермедиаты, то схема трансформируется в схему 7. С помощью схемы 7 можно описать процессы потери пероксидазной и циклооксигеназной активностей в процессе протекания как циклооксигеназной, так и пероксидазной реакции. Рассмотрим случай потери обеих активностей в процессе протекания циклооксигеназной реакции. Циклооксигеназную активность обозначим как A, пероксидазную - как B.

Схема 7. Кинетическая модель инактивации каталитическому циклу реакции.

циклооксигеназной и пероксидазной активностей мента происходит через интермедиат X i путем превращения его в каталитически неактивные интермедиаты. Циклооксигеназная активность фермента ( A) инактивируется путем превращения X i в X * с константой скорости 1. Инактивация пероксидазной активности ( B ) осуществляется путем превращения интермедиата X i пероксидазную активность интермедиат Yi сохраняет циклооксигеназную активность, то есть способность осуществлять цикл ( Y0 … Yi … Y0 ). Интермедиат Yi теряет циклооксигеназную активность в результате превращения в лишенную обеих активностей промежуточную форму фермента X ** с константой скорости 4. Форма фермента X * обладает пероксидазной активностью ( B ) и теряет ее в результате превращения в X ** с константой скорости 3. Полагаем, что для интермедиатов X i и X * пероксидазная активность одинакова.

Предполагаем, что все интермедиаты X и все интермедиаты Y находятся в стационарном состоянии и в первом приближении обладают одинаковыми каталитическими свойствами (константы скоростей реакции для интермедиатов X равны соответствующим константам скорости реакции для интермедиатов Y ). Тогда соотношения [ X i ] / X и [Yi ] / Y для подвергающихся инактивации интермедиатов равны друг другу и определяются концентрациями субстратов:

В качестве количественных характеристик активностей удобно использовать относительные активности ( Aотн ) и ( Bотн ), то есть экспериментально наблюдаемые величины, нормированные на их значения в нулевой момент времени. Решив систему дифференциальных уравнений, соответствующих схеме 7, можно выразить Aотн и Bотн следующим образом:

Так как потеря ферментативной активности в процессе катализа одноименной с этой активностью реакции - это одноэкспонентный процесс (см. рис.9а, 9б, 10 [Smith, Lands, 1972]), предполагаем, что 1 = 4. Это оправдано, так как 1 и 4 описывают потерю циклооксигеназной активности формами фермента X i и Yi, обладающими одинаковыми каталитическими свойствами. Тогда:

независимые константы, которые полностью описывают различные процессы (потеря активности в процессе протекания одноименной реакции и потеря активности в процессе протекания альтернативной реакции). Для оценки значений констант экспериментальные данные (рис.9а, 9б, 10) аппроксимировали согласно этим экспериментальные данные хорошо описываются полученными уравнениями.

третбутилпероксидом на пероксидазную и циклооксигеназную активности.

Инкубация PGHS с перекисью водорода приводит к прогрессивному уменьшению циклооксигеназной и пероксидазной активностей (концентрация перекиси водорода, используемая для проведения инкубации с ферментом и для осуществления пероксидазной реакции равна 1,5 мМ) (рис. 11).

электронов (рис. 11, квадраты), так и в присутствии донора электронов (рис. 11, ромбы). Характер указанных зависимостей сходный.

скорости инактивации () циклооксигеназной активности при прединкубации с перекисью водорода ( = 0,7-1,1 мин-1) меньше, чем пероксидазной ( = 4-6 мин-1).

На рисунке 11 представлены аппроксимации по уравнениям (11), (12). Эти уравнения получены в результате рассмотрения схемы 8 и описаны далее.

относительная активность Нами также были проведены эксперименты по влиянию времени прединкубации инактивирует обе активности PGHS, как и перекись водорода.

Основываясь на результатах, представленных на рисунке 11 можно сделать вывод, что инактивация пероксидазной и циклооксигеназной активностей при прединкубации с перекисью водорода идет по различным механизмам.

Кинетическая модель инактивации циклооксигеназной и пероксидазной активностей PGHS при прединкубации с перекисью водорода. При описании зависимости по влиянию перекиси водорода на циклооксигеназную активность систематические отклонения (рис.12а).

Кинетика изменения циклооксигеназной активности PGHS при прединкубации с перекисью водорода (рис.11) представляет собой характерную кривую с лагпериодом, которую невозможно описать одной экспонентой. Это свидетельствует о том, что механизм потери циклооксигеназной активности содержит, по меньшей мере, две последовательные стадии, последняя из которых приводит к инактивации.

Кинетика изменения пероксидазной активности PGHS при прединкубации с перекисью водорода в тех же условиях имеет двухфазный характер и представляет



Похожие работы:

«Досова Анна Владимировна ТЕОРЕТИЧЕСКИЕ И ПРАКТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ КОМПЛЕКСНОГО КРИМИНАЛИСТИЧЕСКОГО ИССЛЕДОВАНИЯ ДОКУМЕНТОВ С ИЗМЕНЕННЫМИ РЕКВИЗИТАМИ Специальность: 12.00.12 – криминалистика; судебно-экспертная деятельность; оперативно – розыскная деятельность Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата юридических наук Волгоград – 2014 Работа выполнена в федеральном государственном казенном образовательном учреждении высшего профессионального образования...»

«ТУНИК ГАЛИНА АЛЕКСАНДРОВНА СОВРЕМЕННАЯ РОССИЙСКАЯ ГЕРАЛЬДИКА КАК ФАКТОР ОТРАЖЕНИЯ СПЕЦИФИКИ РОССИЙСКОГО ГОСУДАРСТВА: ИСТОРИКО-ПОЛИТОЛОГИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ Специальность 23.00.02 - политические институты, этнополитическая конфликтология, национальные и политические процессы и технологии АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени доктора политических наук Москва 2008 2 Диссертационная работа выполнена на кафедре национальных и федеративных отношений ФГОУ ВПО Российская...»

«Полякова Татьяна Викторовна МАРКЕТИНГ ТЕРРИТОРИЙ КАК ФАКТОР СОЦИАЛЬНО-ЭКОНОМИЧЕСКОГО РАЗВИТИЯ И ФОРМИРОВАНИЯ БЛАГОПРИЯТНОГО ИМИДЖА ТЕРРИТОРИИ 08.00.05 Экономика и управление народным хозяйством: 9 - маркетинг АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата экономических наук Волгоград – 2011 Работа выполнена в Волгоградском государственном техническом университете Научный руководитель доктор экономических наук, профессор Иванюк Ирина Александровна. Официальные...»

«ПЛАКСИН Антон Викторович СОЗДАНИЕ РЕСУРСОСБЕРЕГАЮЩЕЙ ТЕХНОЛОГИИ ШТАМПОВКИ ПОКОВОК ФЛАНЦЕВ ВОРОТНИКОВЫХ НА ОСНОВЕ КОМБИНИРОВАННОЙ СХЕМЫ ДЕФОРМАЦИИ Специальность 05.16.05 – Обработка металлов давлением Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата технических наук Челябинск 2009 Работа выполнена на кафедре Машины и технологии обработки материалов давлением Южно-Уральского государственного университета Научный руководитель – доктор технических наук, профессор...»

«Хан Вин Со ЭКСТРАКЦИОННОЕ РАЗДЕЛЕНИЕ U(VI), Mo(VI) И Cs ИЗ КАРБОНАТНЫХ РАСТВОРОВ КАРБОНАТОМ МЕТИЛТРИАЛКИЛАММОНИЯ 05.17.02 – Технология редких, рассеянных и радиоактивных элементов АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата химических наук Москва – 2010 Работа выполнена в ГОУ ВПО Российский химико-технологический университет имени Д.И.Менделеева. Научный руководитель : доктор химических наук, профессор Степанов Сергей Илларионович Официальные оппоненты :...»

«ЗОРЬКИН Виталий Евгеньевич ЕЖЕГОДНЫЕ ПОСЛАНИЯ ФЕДЕРАЛЬНОМУ СОБРАНИЮ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ КАК СРЕДСТВО ФОРМИРОВАНИЯ И РЕАЛИЗАЦИИ ПРАВОВОЙ ПОЛИТИКИ ПРЕЗИДЕНТА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ Специальность 12.00.01 – теория и история права и государства; история учений о праве и государстве АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата юридических наук Санкт-Петербург – 2011 Работа выполнена на кафедре теории и истории государства и права НОУ ВПО Юридический институт...»

«ШУПЛЕЦОВА Юлия Александровна ФРАЗЕОЛОГИЧЕСКИЕ ЕДИНИЦЫ В ПЕСЕННОМ ФОЛЬКЛОРЕ КУРГАНСКОЙ ОБЛАСТИ: СТРУКТУРНО-СЕМАНТИЧЕСКИЙ И ЛИНГВОКУЛЬТУРОЛОГИЧЕСКИЙ АСПЕКТЫ Специальность 10.02.01 – Русский язык АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата филологических наук Челябинск – 2008 Работа выполнена в Государственном образовательном учреждении высшего профессионального образования Челябинский государственный педагогический университет Научный руководитель : доктор...»

«Борников Александр Вячеславович Биологическая продуктивность березы повислой в градиенте загрязнений от Карабашского медеплавильного комбината 06.03.02 Лесоведение, лесоводство, лесоустройство и лесная таксация Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата сельскохозяйственных наук Екатеринбург – 2012 Электронный архив УГЛТУ Работа выполнена в ФГБОУ ВПО Уральский государственный лесотехнический университет Научный руководитель : доктор...»

«ЗИАДИН ДИЯ САМИ ЭФФЕКТИВНОСТЬ ВОЗДЕЛЫВАНИЯ ЯРОВОЙ ПШЕНИЦЫ ПРИ РАЗЛИЧНЫХ СИСТЕМАХ ОСНОВНОЙ ОБРАБОТКИ ПОЧВЫ В ЗАСУШЛИВЫХ УСЛОВИЯХ ИОРДАНИИ Специальность 06.01.01 – общее земледелие Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата сельскохозяйственных наук Москва – 2009 1 Работа выполнена на кафедре почвоведения и земледелия Российского университета дружбы народов. Научный руководитель : кандидат технических наук, профессор Тагасов Виктор Иванович Официальные...»

«ХОЛОДНЮК ТАТЬЯНА АЛЕКСАНДРОВНА РОЛЬ ИНДИВИДУАЛЬНЫХ ПСИХОФИЗИОЛОГИЧЕСКИХ ПОКАЗАТЕЛЕЙ ШКОЛЬНИКОВ В ПРОЦЕССЕ АДАПТАЦИИ К УСЛОВИЯМ ПРЕДПРОФИЛЬНОЙ ПОДГОТОВКИ И ПРОФИЛЬНОГО ОБУЧЕНИЯ Специальность 19.00.02 – Психофизиология АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата биологических наук Челябинск – 2009 Работа выполнена на кафедре физиологии человека и животных и валеологии ГОУ ВПО Кемеровский государственный университет доктор биологических наук, доцент Научный...»

«УСЕНЮК Светлана Геннадьевна ДИЗАЙН ДЛЯ УСЛОВИЙ СЕВЕРА: ПРИНЦИП СОТВОРЧЕСТВА В ПРОЕКТИРОВАНИИ ТРАНСПОРТНЫХ СРЕДСТВ Специальность 17.00.06 – Техническая эстетика и дизайн Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата искусствоведения Екатеринбург 2011 Работа выполнена на кафедре Индустриальный дизайн ГОУ ВПО Уральская государственная архитектурно-художественная академия Научный руководитель : кандидат искусствоведения, профессор Гарин Николай Петрович...»

«Ступин Владимир Павлович КАРТОГРАФИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ И АНАЛИЗ МОРФОСИСТЕМ (НА ПРИМЕРЕ БАЙКАЛЬСКОЙ ГОРНОЙ СТРАНЫ И ПРИБАЙКАЛЬЯ) 25.00.33 – Картография Автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора технических наук Новосибирск – 2014 Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном образовательном учреждении высшего профессионального образования Иркутский государственный технический университет (ФГБОУ ВПО ИрГТУ). Научный консультант – доктор технических...»

«Кохичко Андрей Николаевич ТЕОРИЯ И МЕТОДИКА ЛИНГВООРИЕНТИРОВАННОГО ОБРАЗОВАНИЯ МЛАДШИХ ШКОЛЬНИКОВ 13.00.02 – теория и методика обучения и воспитания (русский язык, уровень начального образования), педагогические наук и АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени доктора педагогических наук Челябинск – 2012 2 Работа выполнена на кафедре дошкольного и начального образования в государственном бюджетном образовательном учреждении дополнительного профессионального...»

«ФИЛИМОНОВА Наталья Владимировна ФРАЗЕОЛОГИЗМЫ, НОМИНИРУЮЩИЕ ЧЕЛОВЕКА ПО ЧЕРТАМ ХАРАКТЕРА, В РУССКОМ И НЕМЕЦКОМ ЯЗЫКАХ: СТРУКТУРНЫЙ И СЕМАНТИЧЕСКИЙ АСПЕКТЫ Специальность 10.02.20 – Сравнительно-историческое, типологическое и сопоставительное языкознание АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата филологических наук Челябинск, 2011 Работа выполнена в Государственном образовательном учреждении высшего профессионального образования Челябинский государственный...»

«ПРИЩЕПИН БОРИС ИВАНОВИЧ РАЗРАБОТКА И АПРОБАЦИЯ МОДЕЛЕЙ СИСТЕМЫ ПОВЫШЕНИЯ КВАЛИФИКАЦИИ ПЕРСОНАЛА ЕС ОрВД РФ Специальность – 05.22.13. Навигация и управление воздушным движением АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата технических наук Санкт-Петербург 2005 2 Работа выполнена в Федеральном государственном образовательном учреждении высшего профессионального образования СанктПетербургский государственный университет гражданской авиации на кафедре Организация...»

«ВАРКЕНТИН Андрей Владимирович ПОСТВАКЦИНАЛЬНЫЙ ИММУНИТЕТ К ГРИППУ У РАЗНЫХ ВИДОВ ДОМАШНИХ ПТИЦ 06.02.02 Ветеринарная микробиология, вирусология, эпизоотология, микология с микотоксикологией и иммунология АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата ветеринарных наук Владимир – 2011 2 Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном учреждении Федеральный центр охраны здоровья животных (ФГБУ ВНИИЗЖ), г. Владимир Научный руководитель – доктор...»

«ПОДКОЛЗИН РОМАН ВЯЧЕСЛАВОВИЧ ФОРМИРОВАНИЕ И РАЗВИТИЕ РЕГИОНАЛЬНОГО РЫНКА СЕМЯН ЗЕРНОВЫХ КУЛЬТУР Специальность 08.00.05 – экономика и управление народным хозяйством: экономика, организация и управление предприятиями, отраслями, комплексами (АПК и сельское хозяйство) АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата экономических наук ВОРОНЕЖ –2008 Работа выполнена на кафедре информационного обеспечения и моделирования агроэкономических систем ФГОУ ВПО Воронежский...»

«ПЕРФИЛЬЕВ Александр Владимирович ПОЛУЧЕНИЕ И СВОЙСТВА ОРГАНОМИНЕРАЛЬНЫХ ГИДРОФОБНЫХ АДСОРБЕНТОВ НА ОСНОВЕ ПРИРОДНЫХ АЛЮМОСИЛИКАТОВ Специальность 02.00.04 – физическая химия Автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата химических наук Владивосток – 2012 Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном учреждении науки Институте химии Дальневосточного отделения Российской академии наук Научный руководитель : доктор технических наук Юдаков Александр...»

«ЗУЕВА Елизавета Владимировна ВЛИЯНИЕ ПЕРЕСКАЗАННЫХ ДИАЛОГОВ ПЛАТОНА НА ЛИТЕРАТУРНУЮ ФОРМУ ДИАЛОГА С ТРИФОНОМ ИУДЕЕМ СВ. ИУСТИНА ФИЛОСОФА Специальность 10.02.14 – Классическая филология, византийская и новогреческая филология АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата филологических наук Москва – 2011 Работа выполнена на кафедре древних языков и древнехристианской письменности богословского факультета НОУ ВПО Православный СвятоТихоновский Гуманитарный...»

«Бондарь Юрий Николаевич Взаимосвязь функционирования южнотаежных ландшафтов c их структурой (на примере продуктивности лесов краевой зоны Валдайского оледенения) Специальность - 25.00.23 - Физическая география и биогеография, география почв и геохимия ландшафтов АВТОРЕФЕРАТ диссертации на соискание ученой степени кандидата географических наук Москва - 2009 Работа выполнена на кафедре физической географии и ландшафтоведения географического факультета Московского...»








 
2014 www.av.disus.ru - «Бесплатная электронная библиотека - Авторефераты, Диссертации, Монографии, Программы»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.